Колыбелью службы стал век XVIII. Зачатком ее — первые противоэпидемические учреждения (постоянные пограничные карантины, возникшие для ограждения страны от проникновения инфекционных заболеваний из-за рубежа). Тогда в России появились карантинные лекари, их основной обязанностью стало предупреждение эпидемий и борьба с ними.

Страну периодически сотрясали эпидемии холеры, чумы и брюшного тифа. Грозные инфекции, прокатывающиеся по губерниям подобно смерчу, словно косой выкашивали целые улицы, деревни и города. Требовались не только заградительные меры, а большее — система противоэпидемической работы. Идея необходимости создания специальных учреждений санитарно-эпидемиологического профиля зародилась в 70-х годах XIX века. В 1873 г. передовыми земскими врачами Московской губернии создана губернская санитарная комиссия, в задачу которой входили анализ причин заболеваемости населения, просвещение, эпидемиологическая статистика, гигиеническое нормирование. В 1878 г. санитарное бюро организовано и в Петербургском земстве.

Россия

15 сентября 1922 г. — издание декрета Совета Народных Комиссаров РСФСР «О санитарных органах республики».
1931 г. — Советом народных комиссаров издано положение «О Санитарном Совете при Народном комиссариате здравоохранения РСФСР».
1932 г. — выход решения первой Всесоюзной конференции по планированию здравоохранения и рабочего отдыха о повсеместном создании санитарно-эпидемиологических станций.
1933 г. — выход Постановления ЦИК и СНК СССР от 26 июля 1935 г. «О создании Всесоюзной государственной санитарной инспекции».
1936 г. — образование Наркомздрава СССР (20 июля), формирование Всесоюзной санитарно-эпидемиологической службы.
1948 г. — выход постановления Совета Министров СССР от 19 августа 1948 г. «Об утверждении номенклатуры санитарно-эпидемиологических учреждений и организации их», 1949 г. — постановления «О создании Всесоюзной государственной санитарной инспекции и об организации санитарно-противоэпидемической службы».
1951 г. — введено в действие Положение о санитарно-эпидемиологической службе. В Минздраве СССР, в Министерствах здравоохранения союзных республик организованы главные санитарно-эпидемиологические управления. 1952-1955 гг. — сосредоточение всех функций государственного надзора и противоэпидемической деятельности в комплексном учреждении санитарно-эпидемиологической станции.
С 1996 по 2003 г. в соответствии с постановлением Правительства РФ от 14 октября 1996 г. госсанэпидслужба вновь вошла в состав системы Минздрава России. Создан департамент Госсанэпиднадзора Минздрава России.

Якутия

Март 1930 г. — в автономной республике организован Народный комиссариат здравоохранения. Республиканским государственным санитарным инспектором, заместителем наркома назначен Фрол Иванович Савченко.
В состав Ленского водного отдела здравоохранения, переведенного распоряжением Водного сектора Наркомздрава СССР от 25 февраля 1932 года из г. Киренска Иркутской области в город Якутск, вошло восемь санитарных участков, обеспечивающих санэпидобслуживание работников речного транспорта Ленского бассейна, Севморпути и Лензолотофлота.
1935 г. — в девяти районах появляются органы государственной санинспекции. В Вилюйске и Якутске открываются первые малярийные станции.
В 1937 г. побеждена натуральная оспа, в 1938-м — сыпной тиф.
1938 г. — при Наркомате здравоохранения республики создано противоэпидемическое управление. Первым начальником Государственным санитарным инспектором назначен Моисей Яковлевич Хадецкий.
1939 г. — организована межрайонная санитарно-эпидемиологическая станция, обслуживавшая город Якутск, Мегино-Кангаласский, Намский и Орджоникидзевский районы.
1940 г. — создана городская санитарно-эпидемиологическая станция.
1941 г. — образованы четыре санэпидстанции в Якутске, Алдане, Вилюйске и Олекминске, пять малярийных пунктов, две санитарно-бактериологические лаборатории и дезинфекционный пункт.
1947 г. — создание санитарной группы на воздушном транспорте в Якутии.
1949 г. — в Якутске организована Республиканская санитарно-эпидемиологическая станция. В ее составе коревая лаборатория и туляремийный пункт.
В 1956 г. организован отдел особо-опасных инфекций республиканской санэпидстанции, в 1958 г. — лаборатория особо опасных инфекций, в 1959 г. — вирусологическая лаборатория.
1966 г. — начало деятельности Ленской бассейновой санитарно-эпидемиологической станции как подразделения Ленской центральной бассейновой больницы. Созданы бактериологическая, санитарно-гигиеническая лаборатории, противоэпидемический, санитарный отделы, отдел профдезинфекции. В г. Якутске, Ленске, п. Тикси организованы санитарно-контрольные отделы.
В 1969 г. созданы линейные санэпидстанции: Усть-Кутская, Киренская, Пеледуйская, санитарно-противоэпидемические отделы в Жатае, Нижнеянске, Алексеевске, Зырянке.
1972 г. — создан организационный отдел республиканской санэпидстанции.
1972 г. — завершение преобразования санитарно-эпидемиологических отделов центральных и районных больниц в самостоятельные санэпидстанции сельских районов. 1971-1985 гг. — укрепление материально-технической базы санитарно-эпидемиологической службы, её лабораторий, усиление государственных надзорных функций.
1989 г. — служба объединенного авиаотряда преобразована в государственную санитарную службу на воздушном транспорте.
1991 г. — организован Государственный комитет по санэпиднадзору РС(Я).

Санитарные службы на водном, воздушном транспорте, бывшие в составе федерального органа, стали подведомственными санитарной службе Якутии. Республиканская санэпидстанция реорганизована в Республиканский центр госсанэпиднадзора.

Наши дни

Создано Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по РС(Я). Руководителем Управления Роспотребнадзора по РС(Я) является Маргарита Егоровна ИГНАТЬЕВА.
2004 г. — Указом Президента Российской Федерации от 9 марта №314 «О системе и структуре федеральных органов исполнительной власти» образована Федеральная служба по надзору прав потребителей и благополучия человека.
Приказом Роспотребнадзора создано Территориальное управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по РС(Я).
2006 г. — приказом Роспотребнадзора утверждено Положение об Управлении Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по РС(Я).
2005 г. — образованы Федеральный центр гигиены и эпидемиологии для обеспечения госсанэпиднадзора, 90 федеральных государственных учреждений здравоохранения и 1123 филиала.
2011 г. — приказом Роспотребнадзора от 31 марта федеральное государственное учреждение здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в РС(Я)» переименовано в Федеральное бюджетное учреждение здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в РС(Я)».
2012 г. — в соответствии с Указом Президента РФ от 21 мая 2012 г. «О структуре федеральных органов исполнительной власти» Роспотребнадзор является федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции по выработке и реализации государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере защиты прав потребителей, а также по осуществлению федерального государственного санитарно-эпидемиологического надзора, в том числе на железнодорожном транспорте, в целях охраны здоровья населения и среды обитания, а также федерального государственного надзора в области защиты прав потребителей.
Приказом Роспотребнадзора от 9 июля 2012 г. утверждено Положение об Управлении Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по РС(Я).