Создавали его целых тринадцать лет. Еще в 2000 году по инициативе главного врача Анатолия Назарова в РБ № 3 начали собирать материалы для будущего музея. Подняли архивы, чтобы установить имена главных врачей, работников, внесших вклад в становление и развитие больницы со дня ее основания, добавили современные материалы. Этим процессом руководил Иван Ксенофонтов, член Союза журналистов РФ, отличник радио и телевидения СССР, отличник образования РСФСР, заслуженный работник культуры ЯАССР, отличник здравоохранения РС(Я), почетный работник ГБУ РС(Я), почетный гражданин Сунтарского улуса.
Когда в коридоре администрации появились исторические стенды, весь коллектив проникся энтузиазмом, медики стали предлагать свежие идеи, материалы и экспонаты для будущего музея. И таковой появился в преддверии празднования 80‑летия больницы. В поликлинике выделена комната, которая профессионально оформлена, и утвержден пакет учредительных документов. Здесь теперь можно увидеть всю историю больницы, с тех пор, как она была создана как поликлиника ответполитработников, до наших дней, когда Республиканская больница № 3 оказывает якутянам высокотехнологичную медицинскую помощь.