На территории Вилюйска издавна жили кочевые тунгусо-маньчжурские и палеоазиатские роды и племена. В XVII веке население, как пишет профессор Федот Софронов, стало приписываться к зимовьям и острожкам, куда посылались для сбора ясака казаки во главе с приказными. Так, жителей бассейна реки Вилюй приписали к Нижневилюйскому, Средневилюйскому и Верхневилюйскому зимовьям.

Основан казаками
По мнению исследователя Пантелеймона Петрова, нынешний Вилюйск под прежним названием Верхневилюйское зимовье был основан мангазейскими казаками,собиравшими дань с местных тунгусов и якутов, в первой половине XVII столетия. Было это в 1634 году. Надо сказать, что Верхневилюйское зимовье всегда находилось в городской черте современного Вилюйска. В нем началось строительство первой на Вилюе православной церкви Николая Чудотворца. История ее возведения связана с именем архиепископа Иркутского Иннокентия, путешествовавшего в 1740 году по вилюйским улусам. В 1822 году Верхневилюйское селение становится центром округа и получает статус города.
Тогдашний Вилюйский округ представлял большую территорию из пяти округов Якутской области, в которой бы уместились Германия и Франция, вместе взятые. В городе имелись 54 деревянных дома, юрты, складские строения, два магазина и Николаевская церковь. В округе постоянно торговали восемь купцов, среди них такие известные, как Николай Расторгуев и Иван Харитонов. К 1871 году Вилюйск имел четыре улицы: Малую, Набережную, Глухую и Загородную.
Официальным организатором строительства в Вилюйском округе был посланник императрицы Ефрем Ромадин. Как пишет автор книги «Вилюйский Ротшильд» Николай Томский, город строили уральские казаки и башкиры – участники восстания Пугачева, возводившие стены острога, церковь, жилые дома. Здесь несли государеву службу полсотни казаков.
Существует какая-то неразбериха с названием Вилюйска. Так, согласно циркулярам Российской империи его раньше называли Оленском, затем Вилюйском. Исследователь Пантелеймон Петров, изучив архивные материалы, справедливо утверждает, что это не так и Верхневилюйское зимовье является исторической основой одного поселения, а именно города Вилюйска.

Ссылались, родились, жили
В царское время сюда ссылали неугодных власти людей. В Вилюйске жил декабрист, один из основателей «Союза спасения», «Союза благоденствия» Матвей Муравьев-Апостол, учивший детей грамоте, активно участвовавший в общественной жизни города, например, огородил местное кладбище, получал неплохие урожаи картофеля. В 1829 году его перевели в Омскую область.
В Вилюйской ссылке отбывал срок революционер и писатель Николай Чернышевский, об этом периоде его жизни написано много книг и материалов. Он был сослан сюда в 1864-м после семилетней каторги в Сибири и прожил в Вилюйске с 1871-го по 1883 год.
Надо сказать, что в славном городе Вилюйске родились и жили ученый-химик Иван Кондаков, известные купцы Николай Расторгуев и Иван Харитонов, композитор Марк Жирков. Здесь одно время жил классик якутской литературы Алексей Кулаковский и родился его сын Реас Кулаковский, известный прозаик. Вилюйск – родина народного поэта Якутии Ивана Гоголева, Героя Труда, учителя и краеведа Петра Староватова, видного революционера Степана Аржакова, первого секретаря ОК КПСС Гавриила Чиряева, героев Великой Отечественной войны Николая Кондакова, Николая Степанова, Алексея Миронова и других.
Ныне Вилюйск – центр Вилюйского улуса. Недалеко от города разрабатывается месторождение природного газа. Население в основном занято в мясо-молочном производстве, выпуске стройматериалов. В городе работают нефтебаза, дорожно-эксплуатационный участок, центр досуга «Алгыс», народный театр, педучилище и дом-музей Н.Г.Чернышевского, кравеведческий музей имени П.Х.Староватова, неполная средняя, средняя, музыкальная и художественная школы, учреждения здравоохранения, торговли и бытового обслуживания.
Вилюйск живет в ожидании ысыахов. А в конце августа жители и гости города отметят юбилейный 380-й день рождения любимого города.