Проведена масса работы в части изменения российского законодательства в области рыболовства с учетом интересов местного населения и суровости климата в Якутии, разработке и утверждению административных регламентов по предоставлению населению государственных услуг в области рыболовства и, наконец, по зарыблению озер Якутии.

С этого момента началась активная работа по реализации следующих полномочий: организация и регулирование промышленного, любительского и спортивного рыболовства, традиционного рыболовства; распределение квот промышленных, любительских и спортивных, традиционных квот; проведение конкурсов на закрепление рыбопромысловых участков на малых реках и озерах; ведение перечня рыбопромысловых участков республики; охрана и сохранение водных биологических ресурсов.
Сформирован единый перечень рыбопромысловых участков по всей республике, включающих в себя более 1800 участков, как речных, так и озерных для всех видов рыболовства. Ежегодно перечень дополняется новыми участками, но для этого нужно проделать объемную работу совместно с территориальным управлением Росрыболовства, после чего все участки направляются для согласования в само Росрыболовство в Москву. Приобретено оборудование, которое позволит в ближайшее время создать электронную базу данных всех рыбопромысловых участков, что соответственно положительно скажется для населения, так как все данные можно будет посмотреть в сети интернет.
Проведено 11 конкурсов на закрепление рыбопромысловых участков. 10 конкурсов для осуществления промышленного рыболовства и 1 конкурс для традиционного рыболовства. Но если для осуществления традиционного рыболовства закреплять рыбопромысловые участки не обязательно, то осуществление промышленного рыболовства квотируемых видов рыб без закрепленных участков невозможно. Именно по этой причине основная работа по проведению конкурсов проводилась в первые годы работы Управления. За период 2009–2010 годы было закреплено 490 рыбопромысловых участков для осуществления промышленного рыболовства на малых реках и озерах. Проведением конкурсов на закрепление рыбопромысловых участков на крупных реках (Лена, Колыма, Индигирка) занимается территориальное управление Росрыболовства.
Ежегодно на основании выделенной Росрыболовством квоты на республику, управлением осуществляется распределение квоты непосредственно по пользователям.
Любительская и спортивная квота
Для организации любительского и спортивного рыболовства в республике ежегодно Управлением распределяется квота на добычу рыбы между организаторами любительского и спортивного рыболовства. На сегодняшний день организацией любительского и спортивного рыболовства в республике занимаются 2 пользователя: ФГБУ «Якутрыбвод» и ИП Винокуров Г. И., которые оказывают свои услуги в 14 районах республики.
Квота для традиционного рыболовства
Со дня создания Управления велась активная работа как с представителями коренных малочисленных народов Севера, так и с улусными администрациями, в части распределения квоты между представителями КМНС и их общинами для личного потребления.
Из года в год число представителей КМНС, которые получают квоту на рыбу, увеличивается. В 2011 году были утверждены лимиты на добычу рыбы для представителей КМНС. В среднем на 1 человека положено 200–250 кг рыбы в год в зависимости от места проживания.
Промышленная квота
В 2011 году в соответствии с действующим законодательством за промысловиками были закреплены доли квот сроком на 10 лет. Таким образом, организация промышленного рыболовства в республике выстроена таким образом, что квота на вылов рыбы для промысловиков определена на 10 лет вперед, что позволит рыбакам не беспокоиться, получат они в следующем году квоту или нет, а развивать свою материально-техническую базу под определенный объем квоты.